清朝为了对蒙古各部实行统治，康熙三十年(1691)多伦会盟后，开始推行盟旗制度，以一部或数部为一盟，各部落每三年一会盟，设盟长、副盟长各一人。而各部的基本行政单位是旗，旗下则根据人口设置若干“佐”，佐以下则有千户、百户、十户。清朝时期的蒙古共分十八盟、三十二部、二百零一旗（有变动）。
内蒙古六盟内蒙古共分六盟、二十四部、四十九旗
1、哲里木盟，辖四部十旗。科尔沁左翼前旗、科尔沁左翼后旗、科尔沁左翼中旗、科尔沁右翼前旗、科尔沁右翼后旗、科尔沁右翼中旗、郭尔罗斯前旗、郭尔罗斯后旗、杜尔伯特旗和扎赍特旗。
2、卓索图盟，辖二部五旗。土默特左旗、土默特右旗、喀喇沁左旗、喀喇沁右旗和喀喇沁中旗。
3、昭乌达盟，辖八部十一旗。敖汉旗、翁牛特左旗、翁牛特右旗、奈曼旗、巴林左旗、巴林右旗、扎鲁特左旗、扎鲁特右旗、阿鲁科尔沁旗、克什克腾旗和喀尔喀左翼旗。
4、锡林郭勒盟，辖五部十旗。乌珠穆沁左翼、乌珠穆沁右翼、浩齐特左旗、浩齐特右旗、苏尼特左旗、苏尼特右旗、阿巴口戈左旗、阿巴口戈右旗、阿巴哈纳尔左旗和阿巴哈纳尔右旗。
5、乌兰察布盟，辖四部六旗。四子部落旗、茂明安旗、乌喇特前旗、乌喇特后旗、乌喇特中旗和喀尔喀右翼旗。
6、伊克昭盟，辖一部七旗。鄂尔多斯左翼前旗、鄂尔多斯左翼后旗、鄂尔多斯左翼中旗、鄂尔多斯右翼前旗、鄂尔多斯右翼后旗、鄂尔多斯右翼中旗和鄂尔多斯右翼前末旗。
外蒙古四盟外蒙古公分四盟、四部、六十二旗
1、汗阿林盟（土谢图汗部），辖一部十七旗。土谢图汗部中旗、左翼中旗、右翼中旗、中左旗、中右旗、中前旗、中后旗、左翼左旗、右翼左旗、左翼右旗、右翼右旗、左翼前旗、右翼前旗、左翼后旗、右翼后旗、左翼下旗、右翼下旗。该盟变动较大，雍正初年增至三十七旗，雍正三年（1725年）又割让西部二十一旗置赛音诺颜部，改土谢图汗部为喀尔喀后路，不久又增置四旗，达到二十旗。
2、齐齐尔里克盟，辖一部二十四旗（初为十九旗，后增三旗，并附鲁特旗（准噶尔部）两旗）。三音诺颜中旗、中前旗、中后旗、中左旗、中右旗、中末旗、中后末旗、中左末旗、中右末旗、左翼中旗、左翼左旗、左翼右旗、左翼左末旗、右翼前旗、右翼后旗、右翼末旗、右翼中左旗、右翼中右旗、右翼中末旗、右翼左末旗、右末旗、右翼右后旗、额鲁特旗、额鲁特前旗。
3、克鲁伦巴尔和屯盟，辖一部十二旗。车臣汗部中旗、左翼中旗、右翼中旗、中左旗、中右旗、中前旗、中后旗、中下旗、左翼前旗、左翼后旗、右翼前旗、右翼后旗。乾隆年间增至二十三旗。
4、札克毕拉色钦毕都尔诺尔盟，辖一部九旗。札萨克图汗部中旗、左翼左旗、左翼右旗、右翼左旗、右翼右旗、左翼前旗、右翼前旗、左翼后旗、右翼后旗。乾隆年间增至十八旗。
漠西蒙古八盟漠西蒙古除西套蒙古的阿拉善厄鲁特旗和额济纳土尔扈特旗不设盟之外，共分八盟四部六十四旗
1、青海蒙古，辖五部二十八旗。本不设盟，道光三年（1823年）分为左、右翼二盟。和硕特部前头旗、左翼头旗、北前旗、北右翼旗、北左翼旗、北左末旗、北右末旗、东上旗、南左翼中旗、南左翼后旗、南左翼末旗、南右翼中旗、南右翼后旗、南右翼末旗、西前旗、西后旗、西左翼后旗、西右翼后旗、西右翼中旗、西右翼前旗。另有辉特部南旗，绰罗斯部北中旗和南右翼头旗，土尔扈特部西旗、南前旗、南中旗、南后旗，以及喀尔喀部南右旗。
2、南路乌讷恩素珠克图盟：辖旧土尔扈特部五旗。南路旧土尔扈特卓里克图汗旗、南路旧土尔扈特中旗、南路旧土尔扈特右旗、南路旧土尔扈特左旗、南路旧土尔扈特部。
3、北路乌讷恩素珠克图盟：辖旧土尔扈特部四旗。北路旧土尔扈特旗、北路旧土尔扈特右旗、北路旧土尔扈特左旗、北路旧土尔扈特部。
4、东路乌讷恩素珠克图盟：辖旧土尔扈特部三旗。东路旧土尔扈特右旗、东路旧土尔扈特左旗、东路旧土尔扈特部。
5、西路乌讷恩素珠克图盟：辖旧土尔扈特部两旗。西路旧土尔扈特部旗、西路旧土尔扈特部。
6、赛音济雅哈图左翼盟，辖一部十一旗。特古斯库鲁克达赖汗旗、杜尔伯特左翼中旗 、左翼中左旗 、左翼中前旗、左翼中后旗、左翼中上旗、左翼中下旗、左翼中前左旗、左翼中前右旗、左翼中后左旗、左翼中后右旗 。
7、赛音济雅哈图右翼盟，辖五部十旗。杜尔伯特右翼前旗、右翼前右旗、右翼中右旗，另附辉特部下前旗和下后旗，札哈沁部三等信勇公旗和总管旗，新土尔扈特部左旗和右旗，以及新和硕特部旗。
除了以上之外，黑龙江蒙古分为额鲁特部依克明安旗，以及杜尔伯特部的博东齐旗和布图库旗。此外还有游牧喇嘛部落锡哷图库伦札萨克喇嘛、哲布尊丹巴呼图克图、额尔德尼班第达呼图克图、札牙班第达呼图克图、青苏珠克图诺门罕、那鲁班禅呼图克图、察汉诺门罕。
这个问题是这样的，清朝时期（道光后也是一样），蒙古基本上分为三大部分：
漠南蒙古——又称“内扎萨克”或“内蒙古”
漠北蒙古——又称“外扎萨克”或“喀尔喀蒙古”、“外蒙古”
漠西蒙古——又称“卫拉特蒙古”或“额鲁特蒙古”、“青海蒙古”
一、漠南蒙古
内蒙古共有二十四个部落，共四十九旗。分别是：
1、科尔沁部（1部6旗）——博尔济吉特氏
2、扎赉特（1部1旗）——博尔济吉特氏
3、杜尔伯特（1部1旗）——博尔济吉特氏
4、郭尔罗斯（1部2旗）——博尔济吉特氏
5、喀喇沁（1部3旗）——乌梁罕氏
6、土默特（1部2旗）——乌梁罕氏
7、敖汉（1部1旗）——博尔济吉特氏
8、奈曼（1部1旗）——博尔济吉特氏
9、巴林（1部2旗）——博尔济吉特氏
10、阿鲁科尔沁（1部1旗）——博尔济吉特氏
11、扎鲁特（1部2旗）——博尔济吉特氏
12、翁牛特（1部2旗）——博尔济吉特氏
13、喀尔喀左翼（1部1旗）——博尔济吉特氏
14、克什克腾（1部1旗）——博尔济吉特氏
15、乌珠穆沁（1部2旗）——博尔济吉特氏
16、浩齐特（1部2旗）——博尔济吉特氏
17、苏尼特（1部2旗）——博尔济吉特氏
18、阿巴噶（1部2旗）——博尔济吉特氏
19、阿巴哈纳尔（1部2旗）——博尔济吉特氏
20、四子王（1部1旗）——博尔济吉特氏
21、茂明安（1部1旗）——博尔济吉特氏
22、乌拉特（1部3旗）——博尔济吉特氏
23、喀尔喀右翼部（1部1旗）——博尔济吉特氏
24、鄂尔多斯部（1部7旗）——博尔济吉特氏
飘飘注释：内扎萨克蒙古四十九旗中，除喀喇沁三旗和土默特左旗的首领是乌梁罕氏的非黄金家族（成吉思汗后裔）成员外，其余皆为博尔济吉特氏黄金家族成员，这四旗贵族称塔布囊(驸马的意思) ，而其余四十五旗贵族皆称台吉。
二、漠北蒙古
漠北蒙古有包括土谢图汗部，车臣汗部，扎萨克图部和汗赛音诺颜部四个部落（初为三大汗部，赛音诺颜部于雍正时期设立），共辖4盟86旗。
1、土谢图汗部（1部20旗）——博尔济吉特氏。
2、车臣汗部（1部23旗）——博尔济吉特氏。
3、札萨克图汗部（1部18旗）——博尔济吉特氏。
4、赛音诺颜部（1部22旗）——博尔济吉特氏。
三、漠西蒙古
漠西蒙古包括和硕特部、准噶尔部、辉特部、土尔扈特等部28旗、喀尔喀部及诺门罕1旗，为1盟，由西宁办事大臣兼任盟长。
由于漠西蒙古设置比较复杂分散，在此飘飘就不一一列举了，不过大名鼎鼎的噶尔丹就属于漠西准噶尔部。
蒙古各部均设置掌旗王公，有汗王、亲王、郡王、贝勒、贝子等，而且大部分都与清政府保持着密切的婚姻关系。
